单细胞测序一个样本多少钱 一代测序和二代测序的区别

发布时间:2023-11-03 13:52:35
发布者:网友

大家好,今天小编来为大家解答单细胞测序一个样本多少钱这个问题,一代测序和二代测序的区别很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!

一、二代测序工作安全吗

第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(SequencingbySynthesis),即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列,现有的技术平台主要包括Roche/454FLX、Illumina/SolexaGenomeAnalyzer和AppliedBiosystemsSOLIDsystem。

二、一代测序和二代测序的区别

二代测序相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内,但在序列读长方面比起第一代测序技术则要短很多,这也给三代测序提供了发展空间。

原理:ddNTP的2'和3'都不含羟基,其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键,可以用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系(含dNTP)中分别加入一定比例带有标记的ddNTP(分别为ddATP、ddCTP、ddGTP和ddTTP),通过凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的DNA序列。

二代测序:NGS技术(多分子,多克隆)

背景:Sanger测序虽读长较长、准确性高,但由于其测序成本高、通量低等缺点,难以在denovo测序、转录组测序等方面普及应用。经过不断的技术开发和改进,以Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa、Hiseq技术,ABI公司的Solid技术为标志的第二代测序技术诞生,后起之秀ThermoFisher的IonTorrent技术近年来也杀入历史舞台。

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④测序—测序碱基转化为光学信号

特点:Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题,它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短(200bp-500bp)也让其应用有所局限。

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三、二代测序的具体流程

1、测序文库的构建首先准备基因组,然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头。如果是转录组测序,则文库的构建要相对麻烦些,RNA片段化之后需反转成cDNA,然后加上接头,或者先将RNA反转成cDNA,然后再片段化并加上接头。

2、锚定桥接Solexa测序的反应在叫做flowcell的玻璃管中进行,flowcell又被细分成8个Lane,每个Lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的DNA片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构,以供后续的预扩增使用。

3、预扩增添加未标记的dNTP和普通Taq酶进行固相桥式PCR扩增,单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性,释放出互补的单链,锚定到附近的固相表面。通过不断循环,将会在Flowcell的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。

4、单碱基延伸测序在测序的flowcell中加入四种荧光标记的dNTP、DNA聚合酶以及接头引物进行扩增,在每一个测序簇延伸互补链时,每加入一个被荧光标记的dNTP就能释放出相对应的荧光,测序仪通过捕获荧光信号,并通过计算机软件将光信号转化为测序峰,从而获得待测片段的序列信息。

5、数据分析这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分,但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列,要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个基因组的框架,或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的结果。

四、免疫组化和二代测序的区别

1、免疫组化,是应用免疫学基本原理抗原抗体反应,即抗原与抗体特异性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色剂(荧光素、酶、金属离子、同位素)显色来确定组织细胞内抗原(多肽和蛋白质),对其进行定位、定性及相对定量的研究,称为免疫组织化学技术或免疫细胞化学技术。

2、二代测序又称下一代测序技术,是对第一代测序技术的划时代变革的核心。

五、一代测序和二代测序的相同点

都只能读DNA序列,对RNA序列都是要经过读DNA来间接读取

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